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PCR实验室主要实验项目：病毒检测，乙型肝炎，禽疫病，癌基因的检测和诊断，DNA指纹，个体识别，亲子鉴定及法医物证等等。
PCR实验室建设原则上分为四个单独的工作区域：试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区。
1、试剂准备区：用于试验试剂的准备。
该区域为正压，目的是防止污染物质溢入。该区域内部又可分为3个区域：普通提取试剂的准备区、PCR试剂准备区和PCR主反应液准备区。在普通提取试剂的准备区内准备一些样品核酸提取时所需的裂解液、提取液等；PCR试剂准备区用于PCR试剂的制备和保存。例如准备引物、探针等PCR试剂。为了防止交叉污染，避免反复冷冻和解冻，试剂存贮溶液应该被平均为小的工作体积，储存在这个房间以备后用：PCR主反应液准备区将进行主反应混合液(除了样品。所有PCR所需试剂的混合)添加到PCR管的操作。重要提示：不能将其它房间的材料(包括扩增、模板和目标核酸或阳性对照、供应品、或设备)带进试剂准备区。
2、样品准备区：该区域无压力设置要求。
该区域是用于对样品进行分样，将样品进行研磨、粉碎、匀浆的区域。由于在这些粉碎、研磨和匀浆处理过程中会产生气溶胶，因此，存在阳性样品污染后续操作的可能性。该区域与后面的区域应严格隔离，应放在与后面的三个区域隔开的独立的房间中。在样品准备区内还可设立一个专用的封闭区或房间用于样品的接收和储存。这个房间可以放置冰箱用于样品储存，应该和样品准备区其它区域隔离开。样品准备区域的人员不得进入试剂准备区。
3、核酸提取区：核酸提取区是进行样品核酸提取的区域。
该区域为负压，目的是防止核酸溢出造成污染。样品准备区又包括从样品中进行核酸提取和纯化的区域以及将核酸加到包含PCR主反应混合液管中的操作区域。添加完样品后，PCR管的盖子要尽可能快地盖好。使用PCR板和胶盖时，阳性对照和含目标序列的样品要与待测样本分开操作，以避免模板添加时造成交叉污染
重要提示：这个房间里的一切物品不得带人试剂准备区。
4、扩增和产品检测区：该区域是用来进行PCR扩增和PCR分析。
PER仪放置在这个区域。房间保持负压，目的是防止核酸溢出。在该区域人员一定要一直穿戴工作服和手套，在离开房间前脱去，防止扩增子污染其它地点。所有用于扩增和产品检测的设备要指定用于这个房间。PCR分析]二作也设置在该区域，例如：酶切、测序、克隆等，但实验室应尽可能把这些活动分隔在不同区域或不同房间。以降低扩增产物的污染风险。如果没有条件在该区域设立负压，此区域必须建立排风装置。

实验室可分为两大功能工作区：核酸扩增前区和核酸扩增后区。
核酸扩增前区域包括试剂制备室和样品制备室。两个房间各自独立，没有任何空气互通。两个房间相对于外部空气压力处于正压状态。核酸扩增后区域包括扩增区 域和产物分析区域，其可以使用实时荧光PCR仪器、 HIV病毒载量测定器的PCR实验室组合成一个房间。如果该区域分为两个房间，则两个房间也必须各自独立，不 能有空中互通。后扩增区对外部空气压力处负压状态。
实验室根据仪器的功能设置各种工作区域。例如，使用聚合酶联反应：设置试剂储存和准备区域、标本制备区域、扩增区域、扩增产物分析区域四个独立的工作 区域，这是最常用的分区方法。如果需要粉碎样品，则需要添加样品破碎区;如果使用实时荧光PCR法：基因扩增区域、基因产物分析区域可以组合在一个房间;采用 标本处理、核酸提取和扩增检测为一体的自动PCR分析仪，则样品制备区域、扩增区域、扩增产物分析区域可以组合成一个区域，因此PCR实验室原则上设置五个区 域或四个区域或三个区域或两个独立的工作区域。
实验室设备是保障工作质量不可或缺的配置。在PCR实验室设计中，应根据每个实验室的要求提供不同的仪器和设备，如：离心机、生物安全柜、超洁净工作台、电泳（插槽）、电转仪、杂交箱、水浴箱、 DNA测序仪、酶标仪和洗板机等等。
实验室作为一种分子生物学技术，可以放大DNA片段，利用DNA基因跟踪系统更快，更准确地检测人体内的病毒含量。它为医学治疗提供可靠依据，为人们带来了先进的、快速的、高效的医疗依据。

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